本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

下载当前结果

基因 IDTkA01G092770
当前查询版本TK1151
位置Chr01:23460075-23462213 (+)
描述Similar to LOG2: Probable E3 ubiquitin-protein ligase LOG2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_004971 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g09770 在体外作为E3泛素蛋白连接酶,或作为E3复合物的组分,从特定E2泛素结合酶接受泛素,并将其转移至底物。 暂无已核实直接文献
At5g03200 在体外作为E3泛素蛋白连接酶,或作为E3复合物的组分,从特定E2泛素结合酶接受泛素,并将其转移至底物。 暂无已核实直接文献
At3g53410 在体外作为E3泛素蛋白连接酶,或作为E3复合物的组分,从特定E2泛素结合酶接受泛素,并将其转移至底物。 暂无已核实直接文献
At3g06140 在体外作为E3泛素蛋白连接酶,或作为E3复合物的组分,从特定E2泛素结合酶接受泛素,并将其转移至底物。 暂无已核实直接文献
At5g19080 在体外作为E3泛素蛋白连接酶,或作为E3复合物的组分,从特定E2泛素结合酶接受泛素,并将其转移至底物。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0009737response to abscisic acid生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.779; 覆盖度=73.259; E 值=1.49e-116; UniProt GO evidence=IMP:CACAOUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016567protein ubiquitination生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.779; 覆盖度=73.259; E 值=1.49e-116; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathwayUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0080144intracellular amino acid homeostasis生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.779; 覆盖度=73.259; E 值=1.49e-116; UniProt GO evidence=IGI:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0090333regulation of stomatal closure生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.779; 覆盖度=73.259; E 值=1.49e-116; UniProt GO evidence=IMP:CACAOUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.779; 覆盖度=73.259; E 值=1.49e-116; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005886plasma membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.779; 覆盖度=73.259; E 值=1.49e-116; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0004842ubiquitin-protein transferase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.779; 覆盖度=73.259; E 值=1.49e-116; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008270zinc ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.779; 覆盖度=73.259; E 值=1.49e-116; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0061630ubiquitin protein ligase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.779; 覆盖度=73.259; E 值=1.49e-116; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G06140KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.902; 覆盖度=67.967; E 值=5.41e-69UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G09770KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.779; 覆盖度=73.259; E 值=1.49e-116UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G53410KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=64.062; 覆盖度=71.309; E 值=7.68e-109UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G03200KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.793; 覆盖度=91.365; E 值=2.56e-110UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G19080KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=49.407; 覆盖度=70.474; E 值=9.28e-80UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release