基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G092770 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:23460075-23462213 (+) |
| 描述 | Similar to LOG2: Probable E3 ubiquitin-protein ligase LOG2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_004971 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g09770 |
在体外作为E3泛素蛋白连接酶,或作为E3复合物的组分,从特定E2泛素结合酶接受泛素,并将其转移至底物。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g03200 |
在体外作为E3泛素蛋白连接酶,或作为E3复合物的组分,从特定E2泛素结合酶接受泛素,并将其转移至底物。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g53410 |
在体外作为E3泛素蛋白连接酶,或作为E3复合物的组分,从特定E2泛素结合酶接受泛素,并将其转移至底物。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g06140 |
在体外作为E3泛素蛋白连接酶,或作为E3复合物的组分,从特定E2泛素结合酶接受泛素,并将其转移至底物。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g19080 |
在体外作为E3泛素蛋白连接酶,或作为E3复合物的组分,从特定E2泛素结合酶接受泛素,并将其转移至底物。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009737 | response to abscisic acid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.779; 覆盖度=73.259; E 值=1.49e-116; UniProt GO evidence=IMP:CACAO | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.779; 覆盖度=73.259; E 值=1.49e-116; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080144 | intracellular amino acid homeostasis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.779; 覆盖度=73.259; E 值=1.49e-116; UniProt GO evidence=IGI:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0090333 | regulation of stomatal closure | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.779; 覆盖度=73.259; E 值=1.49e-116; UniProt GO evidence=IMP:CACAO | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.779; 覆盖度=73.259; E 值=1.49e-116; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.779; 覆盖度=73.259; E 值=1.49e-116; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004842 | ubiquitin-protein transferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.779; 覆盖度=73.259; E 值=1.49e-116; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.779; 覆盖度=73.259; E 值=1.49e-116; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061630 | ubiquitin protein ligase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.779; 覆盖度=73.259; E 值=1.49e-116; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G06140 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.902; 覆盖度=67.967; E 值=5.41e-69 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G09770 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.779; 覆盖度=73.259; E 值=1.49e-116 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G53410 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=64.062; 覆盖度=71.309; E 值=7.68e-109 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G03200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.793; 覆盖度=91.365; E 值=2.56e-110 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G19080 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=49.407; 覆盖度=70.474; E 值=9.28e-80 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |