基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G024070 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:6209782-6215463 (+) |
| 描述 | Similar to KAT3: Potassium channel KAT3 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_005671 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g32650 |
可能的入向整流钾通道调节(α)亚基。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0718700 |
推测的内向整流钾通道。 | 暂无已核实直接文献 |
Os06g0254200 |
推测的内向整流钾通道。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: P0C550 |
高选择性内向整流钾通道,介导植物根部钾的吸收。 | 暂无已核实直接文献 |
Os01g0648000 |
高选择性内向整流钾通道,介导植物根部钾的吸收。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009624 | response to nematode | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.778; 覆盖度=27.918; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071805 | potassium ion transmembrane transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.778; 覆盖度=27.918; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005783 | endoplasmic reticulum | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.778; 覆盖度=27.918; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.778; 覆盖度=27.918; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.778; 覆盖度=27.918; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034702 | monoatomic ion channel complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.778; 覆盖度=27.918; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005249 | voltage-gated potassium channel activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.778; 覆盖度=27.918; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G32650 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.778; 覆盖度=27.918; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0648000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=44.181; 覆盖度=20.907; E 值=2.01e-119 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |