基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G002790 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:726272-731513 (-) |
| 描述 | Similar to PLGG1: Plastidal glycolate/glycerate translocator 1%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_005993 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 17 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g32080 |
光呼吸所需的乙醇酸/甘油转运蛋白。 | |
At2g35550 |
转录调节因子,与发育过程中涉及的基因调控序列中存在的富含 GA 的元件(GAGA 重复序列)特异性结合。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g01930 |
转录调节因子,与发育过程中涉及的基因调控序列中存在的富含 GA 的元件特异性结合。 | |
At1g14685 |
转录调节因子,与发育过程中涉及的基因调控序列中存在的富含 GA 的元件(GAGA 重复序列)特异性结合。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g68120 |
转录调节因子,与发育过程中涉及的基因调控序列中存在的富含 GA 的元件(GAGA 重复序列)特异性结合。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os10g0114500 |
转录调节因子,与发育过程中涉及的基因调控序列中存在的富含 GA 的元件(GAGA 重复序列)特异性结合。 | 暂无已核实直接文献 |
Os10g0115200 |
转录调节因子,与发育过程中涉及的基因调控序列中存在的富含 GA 的元件(GAGA 重复序列)特异性结合。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009658 | chloroplast organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.607; 覆盖度=80.47; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009737 | response to abscisic acid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.607; 覆盖度=80.47; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009853 | photorespiration | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.607; 覆盖度=80.47; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010118 | stomatal movement | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.607; 覆盖度=80.47; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0012501 | programmed cell death | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.915; 覆盖度=25.497; E 值=3.62e-11; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019835 | cytolysis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.915; 覆盖度=25.497; E 值=3.62e-11; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031640 | killing of cells of another organism | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.915; 覆盖度=25.497; E 值=3.62e-11; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042631 | cellular response to water deprivation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.607; 覆盖度=80.47; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048527 | lateral root development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.607; 覆盖度=80.47; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0097339 | glycolate transmembrane transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.607; 覆盖度=80.47; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1901975 | glycerate transmembrane transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.607; 覆盖度=80.47; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=31.429; 覆盖度=25.316; E 值=1.76e-12; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.607; 覆盖度=80.47; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009706 | chloroplast inner membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.607; 覆盖度=80.47; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.607; 覆盖度=80.47; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043879 | glycolate transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.607; 覆盖度=80.47; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1901974 | glycerate transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.607; 覆盖度=80.47; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G32080 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.607; 覆盖度=80.47; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bsu:BSU38330 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=31.429; 覆盖度=25.316; E 值=1.76e-12 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sep:SE_2014 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.915; 覆盖度=25.497; E 值=3.62e-11 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ser:SERP2027 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=31.206; 覆盖度=25.497; E 值=1.25e-10 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ssp:SSP0461 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.915; 覆盖度=25.497; E 值=3.16e-10 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |