基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_037713 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr09:19160948-19163561 (+) |
| 描述 | Similar to SPD1: Protein SEEDLING PLASTID DEVELOPMENT 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_037713 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g10420 |
胚胎中eoplast质体(种子成熟脱绿和脱水阶段高度简化的质体)的发育,以及幼苗生长早期该质体的再分化所必需。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009657 | plastid organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.565; 覆盖度=84.934; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010431 | seed maturation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.565; 覆盖度=84.934; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030435 | sporulation resulting in formation of a cellular spore | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=28.03; 覆盖度=38.996; E 值=6.67e-12; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0090677 | reversible differentiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.565; 覆盖度=84.934; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.565; 覆盖度=84.934; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.565; 覆盖度=84.934; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031969 | chloroplast membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.565; 覆盖度=84.934; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031972 | chloroplast intermembrane space | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.565; 覆盖度=84.934; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003676 | nucleic acid binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=42.807; 覆盖度=84.195; E 值=4.79e-144; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.565; 覆盖度=84.934; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G10420 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.565; 覆盖度=84.934; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bsu:BSU24430 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=28.03; 覆盖度=38.996; E 值=6.67e-12 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |