基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_036996 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:51488628-51497646 (+) |
| 描述 | Similar to HULK3: Protein HUA2-LIKE 3 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_036996 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g63070 |
可能的转录因子,与 HULK1 和 HULK2 具有部分冗余作用。 | |
At2g48160 |
可能的转录因子,与 HULK1 和 HULK3 具有部分冗余作用。 | |
At5g23150 |
通过提高FLC、FLM/MAF1、MAF2和SVP等延迟开花基因的表达,抑制开花的转录因子。 |
HUA1 and HUA2 are two members of the floral homeotic AGAMOUS pathway.1999 · DOI: 10.1016/s1097-2765(00)80462-1 Two RNA binding proteins, HEN4 and HUA1, act in the processing of AGAMOUS pre-mRNA in Arabidopsis thaliana.2003 · DOI: 10.1016/s1534-5807(02)00399-4
|
At5g08230 |
可能的转录因子,与 HULK2 和 HULK3 具有部分冗余作用。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006338 | chromatin remodeling | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.096; 覆盖度=25.496; E 值=3.4e-91; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.096; 覆盖度=25.496; E 值=3.4e-91; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006397 | mRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.096; 覆盖度=25.496; E 值=3.4e-91; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009908 | flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.096; 覆盖度=25.496; E 值=3.4e-91; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009910 | negative regulation of flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.307; 覆盖度=23.588; E 值=7.58e-62; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030154 | cell differentiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.307; 覆盖度=23.588; E 值=7.58e-62; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043481 | anthocyanin accumulation in tissues in response to UV light | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.307; 覆盖度=23.588; E 值=7.58e-62; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048497 | maintenance of floral organ identity | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.307; 覆盖度=23.588; E 值=7.58e-62; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048510 | regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.307; 覆盖度=23.588; E 值=7.58e-62; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.096; 覆盖度=25.496; E 值=3.4e-91; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.307; 覆盖度=23.588; E 值=7.58e-62; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G48160 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.923; 覆盖度=44.656; E 值=3.97e-73 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G63070 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.096; 覆盖度=25.496; E 值=3.4e-91 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G23150 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.307; 覆盖度=23.588; E 值=7.58e-62 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |