基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_036640 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:45829636-45832998 (-) |
| 描述 | Similar to CRTISO: Prolycopene isomerase%2C chloroplastic (Solanum lycopersicum OX%3D4081) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_036640 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g06820 |
胡萝卜素顺反异构酶，可将 7,9,9'-三顺式神经孢子烯转化为 9'-顺式神经孢子烯，并将 7,9,9',7'-四顺式番茄红素转化为全反式番茄红素。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009662 | etioplast organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=86.513; 覆盖度=81.604; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016117 | carotenoid biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.017; 覆盖度=92.767; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=86.513; 覆盖度=81.604; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031969 | chloroplast membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.017; 覆盖度=92.767; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016491 | oxidoreductase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.017; 覆盖度=92.767; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046608 | carotenoid isomerase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.017; 覆盖度=92.767; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G06820 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=86.513; 覆盖度=81.604; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dcr:108219304 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=77.941; 覆盖度=96.226; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sly:101267857 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.017; 覆盖度=92.767; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |