基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_036587 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:44994146-44999995 (-) |
| 描述 | Similar to Probable phytol kinase 3%2C chloroplastic (Glycine max OX%3D3847) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_036587 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g58560 |
激酶,参与脱落酸(ABA)信号的负调控。 | |
At5g04490 |
参与植物代谢中叶绿素降解产物植醇的活化与再利用,包括生育酚生物合成的激酶。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0832000 |
参与植物代谢中叶绿素降解产生的植醇的活化和再利用,包括生育酚的生物合成。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006720 | isoprenoid metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.667; 覆盖度=71.025; E 值=2.85e-97; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009737 | response to abscisic acid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.667; 覆盖度=71.025; E 值=2.85e-97; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010189 | vitamin E biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.92; 覆盖度=92.226; E 值=2.99e-109; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016487 | farnesol metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.667; 覆盖度=71.025; E 值=2.85e-97; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048440 | carpel development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.667; 覆盖度=71.025; E 值=2.85e-97; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.667; 覆盖度=71.025; E 值=2.85e-97; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031969 | chloroplast membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.92; 覆盖度=92.226; E 值=2.99e-109; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010276 | phytol kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.92; 覆盖度=92.226; E 值=2.99e-109; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016301 | kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.92; 覆盖度=92.226; E 值=2.99e-109; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0052673 | prenol kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.667; 覆盖度=71.025; E 值=2.85e-97; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G04490 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.475; 覆盖度=76.678; E 值=2.46e-56 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G58560 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.667; 覆盖度=71.025; E 值=2.85e-97 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | gmx:100788252 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=44.55; 覆盖度=74.558; E 值=4.95e-60 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | gmx:100793696 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.92; 覆盖度=92.226; E 值=2.99e-109 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |