基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_036342 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:40385577-40385906 (-) |
| 描述 | Similar to Os02g0460200: Flowering-promoting factor 1-like protein 3 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_036342 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g24860 |
调节顶端分生组织的开花能力。 | |
At5g10625 |
调节顶端分生组织的开花能力。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0460200 |
类似促进开花因子1的蛋白3。 | 暂无已核实直接文献 |
Os01g0257300 |
GTP 结合蛋白,在根系统发育中发挥作用,由生长素介导。 |
Overexpression of OsRAA1 causes pleiotropic phenotypes in transgenic rice plants, including altered leaf, flower, and root development and root response to gravity.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.041996
|
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009733 | response to auxin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=58.716; 覆盖度=100.0; E 值=2.39e-40; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009909 | regulation of flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.5; 覆盖度=102.752; E 值=8.61e-44; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009911 | positive regulation of flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=59.259; 覆盖度=99.083; E 值=4.7e-40; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010228 | vegetative to reproductive phase transition of meristem | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=59.259; 覆盖度=99.083; E 值=4.7e-40; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045841 | negative regulation of mitotic metaphase/anaphase transition | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=58.716; 覆盖度=100.0; E 值=2.39e-40; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000280 | regulation of root development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=58.716; 覆盖度=100.0; E 值=2.39e-40; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=58.716; 覆盖度=100.0; E 值=2.39e-40; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=58.716; 覆盖度=100.0; E 值=2.39e-40; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=59.259; 覆盖度=99.083; E 值=4.7e-40; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005525 | GTP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=58.716; 覆盖度=100.0; E 值=2.39e-40; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G10625 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=59.091; 覆盖度=100.917; E 值=1.63e-38 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G24860 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=59.259; 覆盖度=99.083; E 值=4.7e-40 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0257300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=58.716; 覆盖度=100.0; E 值=2.39e-40 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0460200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.5; 覆盖度=102.752; E 值=8.61e-44 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |