基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_036282 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:39226156-39227103 (+) |
| 描述 | Similar to DREB2F: Dehydration-responsive element-binding protein 2F (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_036282 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g57600 |
特异性结合 DNA 序列 5'-[AG]CCGAC-3' 的转录激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g75490 |
推定的转录激活子,特异性结合DNA序列5'-[AG]CCGAC-3'。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g18450 |
特异性结合 DNA 序列 5'-[AG]CCGAC-3' 的转录激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0174400 |
可能的转录激活因子,可结合顺式作用脱水响应元件(DRE)的 DNA 序列5'-[AG]CCGAC-3'。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2WL19 |
特异性结合 DNA 序列 5'-[AG]CCGAC-3' 的转录激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.738; 覆盖度=85.614; E 值=4.57e-80; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006950 | response to stress | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.738; 覆盖度=85.614; E 值=4.57e-80; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045893 | positive regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.738; 覆盖度=85.614; E 值=4.57e-80; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.738; 覆盖度=85.614; E 值=4.57e-80; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.738; 覆盖度=85.614; E 值=4.57e-80; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.738; 覆盖度=85.614; E 值=4.57e-80; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G75490 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=70.886; 覆盖度=27.719; E 值=4.81e-34 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G57600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.738; 覆盖度=85.614; E 值=4.57e-80 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G18450 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=73.333; 覆盖度=26.316; E 值=2.31e-32 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0174400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.312; 覆盖度=110.175; E 值=2.53e-64 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |