基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_036003 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:33933437-33938205 (+) |
| 描述 | Similar to SCAR2: Protein SCAR2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_036003 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 15 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g38440 |
参与调节肌动蛋白和微管组织。 | |
At5g01730 |
参与调节肌动蛋白和微管组织。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g29170 |
参与调节肌动蛋白和微管组织。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: Q84TX2 |
参与调节肌动蛋白和微管组织。 | 暂无已核实直接文献 |
Os01g0208600 |
参与调节肌动蛋白和微管组织。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010090 | trichome morphogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.679; 覆盖度=43.93; E 值=9.13e-118; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010091 | trichome branching | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.679; 覆盖度=43.93; E 值=9.13e-118; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030036 | actin cytoskeleton organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.679; 覆盖度=43.93; E 值=9.13e-118; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045010 | actin nucleation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.679; 覆盖度=43.93; E 值=9.13e-118; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051127 | positive regulation of actin nucleation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.679; 覆盖度=43.93; E 值=9.13e-118; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0098609 | cell-cell adhesion | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.679; 覆盖度=43.93; E 值=9.13e-118; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000601 | positive regulation of Arp2/3 complex-mediated actin nucleation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.679; 覆盖度=43.93; E 值=9.13e-118; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.679; 覆盖度=43.93; E 值=9.13e-118; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005856 | cytoskeleton | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.679; 覆盖度=43.93; E 值=9.13e-118; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=56.506; 覆盖度=24.93; E 值=1.1e-94; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010287 | plastoglobule | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=56.506; 覆盖度=24.93; E 值=1.1e-94; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031209 | SCAR complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.679; 覆盖度=43.93; E 值=9.13e-118; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003779 | actin binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.679; 覆盖度=43.93; E 值=9.13e-118; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034237 | protein kinase A regulatory subunit binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.679; 覆盖度=43.93; E 值=9.13e-118; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071933 | Arp2/3 complex binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.679; 覆盖度=43.93; E 值=9.13e-118; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G38440 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.679; 覆盖度=43.93; E 值=9.13e-118 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G01730 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=56.506; 覆盖度=24.93; E 值=1.1e-94 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |