基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_035933 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:32412666-32413485 (+) |
| 描述 | Similar to CML42: Calcium-binding protein CML42 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_035933 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g20780 |
可能在体外结合钙的钙传感器。 | |
At5g44460 |
钙结合蛋白,可能在植物防御反应期间介导钙依赖性信号。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0331700 |
潜在的钙感受器。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010091 | trichome branching | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.612; 覆盖度=94.686; E 值=2.04e-67; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051592 | response to calcium ion | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=56.15; 覆盖度=90.338; E 值=1.43e-61; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=56.15; 覆盖度=90.338; E 值=1.43e-61; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=56.15; 覆盖度=90.338; E 值=1.43e-61; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=56.15; 覆盖度=90.338; E 值=1.43e-61; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.612; 覆盖度=94.686; E 值=2.04e-67; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005509 | calcium ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.612; 覆盖度=94.686; E 值=2.04e-67; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061891 | calcium ion sensor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=56.15; 覆盖度=90.338; E 值=1.43e-61; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G20780 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.612; 覆盖度=94.686; E 值=2.04e-67 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G44460 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=56.15; 覆盖度=90.338; E 值=1.43e-61 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0331700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.438; 覆盖度=92.754; E 值=1.72e-51 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |