基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_035845 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:30516743-30520492 (+) |
| 描述 | Similar to PSAF: Photosystem I reaction center subunit III%2C chloroplastic (Flaveria trinervia OX%3D4227) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_035845 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 1 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g31330 |
参与提高质体蓝素向P700传递电子的效率;在藻类和蓝细菌中,对应的电子供体为细胞色素c553。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0015979 | photosynthesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=83.19; 覆盖度=102.203; E 值=2.08e-135; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=78.061; 覆盖度=86.344; E 值=1.46e-108; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=78.061; 覆盖度=86.344; E 值=1.46e-108; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009534 | chloroplast thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=78.061; 覆盖度=86.344; E 值=1.46e-108; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=83.19; 覆盖度=102.203; E 值=2.08e-135; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009538 | photosystem I reaction center | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=83.19; 覆盖度=102.203; E 值=2.08e-135; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009543 | chloroplast thylakoid lumen | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=83.19; 覆盖度=102.203; E 值=2.08e-135; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009579 | thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=78.061; 覆盖度=86.344; E 值=1.46e-108; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=78.061; 覆盖度=86.344; E 值=1.46e-108; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010287 | plastoglobule | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=78.061; 覆盖度=86.344; E 值=1.46e-108; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=78.061; 覆盖度=86.344; E 值=1.46e-108; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019904 | protein domain specific binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=78.061; 覆盖度=86.344; E 值=1.46e-108; UniProt GO evidence=IPI:CAFA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051219 | phosphoprotein binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=69.432; 覆盖度=100.881; E 值=3.45e-105; UniProt GO evidence=IPI:CAFA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G31330 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=78.061; 覆盖度=86.344; E 值=1.46e-108 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |