基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_035738 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:27949667-27950029 (+) |
| 描述 | Similar to IMK2: Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase IMK2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_035738 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g51740 |
可能不活跃的富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 IMK2。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g56100 |
能磷酸化 AGL24。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g28650 |
参与调控维管组织发育过程中原形成层的维持和极性。 | |
At4g08850 |
作为十字花科植物SCOOP肽的受体,调节包括植物生长、发育和应激反应在内的多种过程。 |
A receptor heteromer mediates the male perception of female attractants in plants.2016 · DOI: 10.1038/nature16975 Perception of a divergent family of phytocytokines by the Arabidopsis receptor kinase MIK2.2021 · DOI: 10.1038/s41467-021-20932-y
|
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os06g0225300 |
可能通过油菜素甾醇(BR)信号通路参与植物生长调控。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.381; 覆盖度=70.0; E 值=3.34e-22; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009505 | plant-type cell wall | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.381; 覆盖度=70.0; E 值=3.34e-22; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.381; 覆盖度=70.0; E 值=3.34e-22; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=47.126; 覆盖度=72.5; E 值=4.57e-17; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004672 | protein kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.381; 覆盖度=70.0; E 值=3.34e-22; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004674 | protein serine/threonine kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=47.126; 覆盖度=72.5; E 值=4.57e-17; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.381; 覆盖度=70.0; E 值=3.34e-22; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0106310 | protein serine kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=47.126; 覆盖度=72.5; E 值=4.57e-17; UniProt GO evidence=IEA:RHEA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G51740 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.381; 覆盖度=70.0; E 值=3.34e-22 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G56100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=47.126; 覆盖度=72.5; E 值=4.57e-17 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |