基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_035681 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:26981918-26986897 (-) |
| 描述 | Similar to At1g76050: RNA pseudouridine synthase 2%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_035681 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g76050 |
RNA 假尿苷合成酶 2，叶绿体型。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g38540 |
单加氧酶 2。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g05320 |
单加氧酶3。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os06g0717400 |
RNA 假尿苷合成酶 2，叶绿体型。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000455 | enzyme-directed rRNA pseudouridine synthesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.407; 覆盖度=40.58; E 值=1.18e-169; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0002239 | response to oomycetes | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.988; 覆盖度=44.928; E 值=5.95e-67; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.988; 覆盖度=44.928; E 值=5.95e-67; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.057; 覆盖度=39.242; E 值=4.9e-62; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.988; 覆盖度=44.928; E 值=5.95e-67; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.407; 覆盖度=40.58; E 值=1.18e-169; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.407; 覆盖度=40.58; E 值=1.18e-169; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004497 | monooxygenase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.988; 覆盖度=44.928; E 值=5.95e-67; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009982 | pseudouridine synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.407; 覆盖度=40.58; E 值=1.18e-169; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071949 | FAD binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.988; 覆盖度=44.928; E 值=5.95e-67; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0120159 | rRNA pseudouridine synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.057; 覆盖度=39.242; E 值=4.9e-62; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G76050 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.407; 覆盖度=40.58; E 值=1.18e-169 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G38540 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.988; 覆盖度=44.928; E 值=5.95e-67 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G05320 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=33.002; 覆盖度=44.928; E 值=9.51e-66 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bsu:BSU15460 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.057; 覆盖度=39.242; E 值=4.9e-62 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0717400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=61.6; 覆盖度=41.806; E 值=1.84e-149 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |