基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_035555 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:24500451-24507355 (+) |
| 描述 | Similar to Thioredoxin F-type%2C chloroplastic (Mesembryanthemum crystallinum OX%3D3544) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_035555 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g16400 |
可能的硫醇-二硫化物氧化还原酶,参与对还原性戊糖磷酸途径(卡尔文-本森循环)和氧化性戊糖磷酸途径酶的氧化还原调控。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0913000 |
硫醇-二硫氧化还原酶,参与还原性戊糖磷酸途径(卡尔文-本森循环)和氧化性戊糖磷酸途径酶的氧化还原调控。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009642 | response to light intensity | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=79.0; 覆盖度=27.027; E 值=6.8e-48; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045454 | cell redox homeostasis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=79.0; 覆盖度=27.027; E 值=6.8e-48; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=65.217; 覆盖度=31.081; E 值=1.62e-45; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.265; 覆盖度=40.811; E 值=9.55e-52; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=79.0; 覆盖度=27.027; E 值=6.8e-48; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=79.0; 覆盖度=27.027; E 值=6.8e-48; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008047 | enzyme activator activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=79.0; 覆盖度=27.027; E 值=6.8e-48; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015035 | protein-disulfide reductase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=65.217; 覆盖度=31.081; E 值=1.62e-45; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G16400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=79.0; 覆盖度=27.027; E 值=6.8e-48 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0913000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=57.692; 覆盖度=42.162; E 值=4.24e-46 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |