基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_035476 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:23299934-23303049 (+) |
| 描述 | Similar to SWI3B: SWI/SNF complex subunit SWI3B (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_035476 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 17 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g33610 |
相当于 SWI/SNF 复合体的多蛋白复合体的组成部分，SWI/SNF 复合体是一种 ATP 依赖性染色质重塑复合体，是大量基因的基因表达的正向和负向调节所必需的。 |
AtSWI3B, an Arabidopsis homolog of SWI3, a core subunit of yeast Swi/Snf chromatin remodeling complex, interacts with FCA, a regulator of flowering time.2002 · DOI: 10.1093/nar/gkf458
|
At1g21700 |
相当于 SWI/SNF 复合体的多蛋白复合体的组成部分，SWI/SNF 复合体是一种 ATP 依赖性染色质重塑复合体，是大量基因的基因表达的正向和负向调节所必需的。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0480300 |
相当于 SWI/SNF 复合体的多蛋白复合体的组成部分，SWI/SNF 复合体是一种 ATP 依赖性染色质重塑复合体，是大量基因的基因表达的正向和负向调节所必需的。 | 暂无已核实直接文献 |
Os11g0183700 |
相当于 SWI/SNF 复合体的多蛋白复合体的组成部分，SWI/SNF 复合体是一种 ATP 依赖性染色质重塑复合体，是大量基因的基因表达的正向和负向调节所必需的。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006325 | chromatin organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.158; 覆盖度=107.961; E 值=2.77e-43; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006338 | chromatin remodeling | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.0; 覆盖度=85.049; E 值=3.9e-135; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.0; 覆盖度=85.049; E 值=3.9e-135; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006357 | regulation of transcription by RNA polymerase II | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.078; 覆盖度=89.903; E 值=1.11e-40; UniProt GO evidence=TAS:PomBase | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0040029 | epigenetic regulation of gene expression | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.0; 覆盖度=85.049; E 值=3.9e-135; UniProt GO evidence=NAS:ComplexPortal | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045815 | transcription initiation-coupled chromatin remodeling | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.078; 覆盖度=89.903; E 值=1.11e-40; UniProt GO evidence=IC:PomBase | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045893 | positive regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.078; 覆盖度=89.903; E 值=1.11e-40; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000070 | regulation of response to water deprivation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=26.21; 覆盖度=96.311; E 值=5.88e-38; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000785 | chromatin | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.078; 覆盖度=89.903; E 值=1.11e-40; UniProt GO evidence=NAS:ComplexPortal | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.0; 覆盖度=85.049; E 值=3.9e-135; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005654 | nucleoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=26.21; 覆盖度=96.311; E 值=5.88e-38; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.078; 覆盖度=89.903; E 值=1.11e-40; UniProt GO evidence=HDA:PomBase | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016514 | SWI/SNF complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.0; 覆盖度=85.049; E 值=3.9e-135; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016586 | RSC-type complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.078; 覆盖度=89.903; E 值=1.11e-40; UniProt GO evidence=IDA:PomBase | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.0; 覆盖度=85.049; E 值=3.9e-135; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.078; 覆盖度=89.903; E 值=1.11e-40; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042393 | histone binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.078; 覆盖度=89.903; E 值=1.11e-40; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G21700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=25.651; 覆盖度=96.893; E 值=6.28e-39 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G33610 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.0; 覆盖度=85.049; E 值=3.9e-135 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0480300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.158; 覆盖度=107.961; E 值=2.77e-43 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os11g0183700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=26.21; 覆盖度=96.311; E 值=5.88e-38 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | spo:2541851 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.078; 覆盖度=89.903; E 值=1.11e-40 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |