基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_035064 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:13232942-13234339 (-) |
| 描述 | Similar to TOPP4: Serine/threonine-protein phosphatase PP1 isozyme 4 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_035064 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g39840 |
丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶,在体外对磷酸对硝基苯酯 具有磷酸酶活性。 |
Arabidopsis DELLA protein degradation is controlled by a type-one protein phosphatase, TOPP4.2014 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1004464
|
At5g59160 |
丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶,在体外对对硝基苯基磷酸盐(pNPP)具有磷酸酶活性。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0268000 |
丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶PP1。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006468 | protein phosphorylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.636; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006470 | protein dephosphorylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.636; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009740 | gibberellic acid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.636; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010161 | red light signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.636; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016311 | dephosphorylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.636; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000164 | protein phosphatase type 1 complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.636; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.636; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.636; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=83.882; 覆盖度=98.701; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004722 | protein serine/threonine phosphatase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.636; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.636; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G39840 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.636; 覆盖度=100.0; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G59160 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=83.882; 覆盖度=98.701; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0268000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=87.013; 覆盖度=100.0; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | nta:107801901 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=90.132; 覆盖度=98.701; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | nta:107829724 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=84.488; 覆盖度=98.377; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |