基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_035022 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:11464597-11466679 (+) |
| 描述 | Similar to HEXBP: DNA-binding protein HEXBP (Leishmania major OX%3D5664) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_035022 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 16 条 GO 注释和 1 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g55340 |
介导极化 mRNA 的 RNA 结合蛋白(例如)。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0620700 |
参与前rRNA加工和核糖体组装。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000914 | phragmoplast assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.689; 覆盖度=71.993; E 值=1.55e-27; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006397 | mRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=29.73; 覆盖度=36.573; E 值=7.63e-17; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009451 | RNA modification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=29.73; 覆盖度=36.573; E 值=7.63e-17; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009920 | cell plate formation involved in plant-type cell wall biogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.689; 覆盖度=71.993; E 值=1.55e-27; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045087 | innate immune response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=29.73; 覆盖度=36.573; E 值=7.63e-17; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1901259 | chloroplast rRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=29.73; 覆盖度=36.573; E 值=7.63e-17; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.689; 覆盖度=71.993; E 值=1.55e-27; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.689; 覆盖度=71.993; E 值=1.55e-27; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009524 | phragmoplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.689; 覆盖度=71.993; E 值=1.55e-27; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=29.73; 覆盖度=36.573; E 值=7.63e-17; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990904 | ribonucleoprotein complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=29.73; 覆盖度=36.573; E 值=7.63e-17; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=29.268; 覆盖度=40.527; E 值=4.4e-19; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.689; 覆盖度=71.993; E 值=1.55e-27; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.689; 覆盖度=71.993; E 值=1.55e-27; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008266 | poly(U) RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=29.73; 覆盖度=36.573; E 值=7.63e-17; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.689; 覆盖度=71.993; E 值=1.55e-27; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G55340 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.689; 覆盖度=71.993; E 值=1.55e-27 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |