基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_034308 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr07:96083495-96086891 (-) |
| 描述 | Similar to RR9: Two-component response regulator ORR9 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_034308 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g57040 |
充当参与 His-to-Asp 磷酸中继信号转导系统的响应调节器。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os11g0143300 |
充当参与 His-to-Asp 磷酸中继信号转导系统的响应调节器。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: Q4GZK2 |
充当参与 His-to-Asp 磷酸中继信号转导系统的响应调节器。 | 暂无已核实直接文献 |
Os12g0139400 |
充当参与 His-to-Asp 磷酸中继信号转导系统的响应调节器。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: B8BLZ4 |
充当参与 His-to-Asp 磷酸中继信号转导系统的响应调节器。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000160 | phosphorelay signal transduction system | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=44.0; E 值=3.08e-66; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=44.0; E 值=3.08e-66; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=64.671; 覆盖度=47.714; E 值=3.14e-61; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0007623 | circadian rhythm | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=64.671; 覆盖度=47.714; E 值=3.14e-61; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009735 | response to cytokinin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=71.429; 覆盖度=44.0; E 值=3.08e-66; UniProt GO evidence=IC:Gramene | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009736 | cytokinin-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=44.0; E 值=3.08e-66; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=71.429; 覆盖度=44.0; E 值=4.76e-66; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=64.671; 覆盖度=47.714; E 值=3.14e-61; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000156 | phosphorelay response regulator activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=64.671; 覆盖度=47.714; E 值=3.14e-61; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G57040 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=64.671; 覆盖度=47.714; E 值=3.14e-61 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os11g0143300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=44.0; E 值=3.08e-66 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os12g0139400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=71.429; 覆盖度=44.0; E 值=4.76e-66 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |