基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_034107 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr07:82279820-82286062 (-) |
| 描述 | Similar to DBP2: ATP-dependent RNA helicase DBP2 (Scheffersomyces stipitis (strain ATCC 58785 / CBS 6054 / NBRC 10063 / NRRL Y-11545) OX%3D322104) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_034107 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 15 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
当前来源表未检出该物种的同源命中。
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0911100 |
ATP 依赖性 RNA 解旋酶，参与无义介导的 mRNA 降解和通过 rRNA 加工的核糖体生成。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000184 | nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.655; 覆盖度=19.933; E 值=6.25e-15; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006364 | rRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.655; 覆盖度=19.933; E 值=6.25e-15; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006369 | termination of RNA polymerase II transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.655; 覆盖度=19.933; E 值=6.25e-15; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblFungi | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071042 | nuclear polyadenylation-dependent mRNA catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.655; 覆盖度=19.933; E 值=6.25e-15; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblFungi | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.655; 覆盖度=19.933; E 值=6.25e-15; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.655; 覆盖度=19.933; E 值=6.25e-15; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990904 | ribonucleoprotein complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.879; 覆盖度=23.618; E 值=1.12e-14; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0002151 | G-quadruplex RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.655; 覆盖度=19.933; E 值=6.25e-15; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblFungi | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=39.823; 覆盖度=18.928; E 值=2.93e-14; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003724 | RNA helicase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.655; 覆盖度=19.933; E 值=6.25e-15; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.655; 覆盖度=19.933; E 值=6.25e-15; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblFungi | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.655; 覆盖度=19.933; E 值=6.25e-15; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016887 | ATP hydrolysis activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.655; 覆盖度=19.933; E 值=6.25e-15; UniProt GO evidence=IEA:RHEA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030515 | snoRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.655; 覆盖度=19.933; E 值=6.25e-15; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblFungi | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051880 | G-quadruplex DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.655; 覆盖度=19.933; E 值=6.25e-15; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblFungi | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | cgr:2890547 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=39.823; 覆盖度=18.928; E 值=1.03e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | pic:PICST_82821 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.655; 覆盖度=19.933; E 值=6.25e-15 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | vpo:Kpol_165p1 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.823; 覆盖度=18.928; E 值=9.56e-15 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |