基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_032710 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr07:28214718-28216942 (+) |
| 描述 | Similar to APRR7: Two-component response regulator-like APRR7 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_032710 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g02810 |
CCA1 和 LHY 的转录抑制因子,以及 LWD1 和 LWD2 表达的正调节因子。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0284100 |
控制光周期开花反应。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2XFB7 |
控制光周期开花反应。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2YQ93 |
控制光周期开花反应。 | 暂无已核实直接文献 |
Os07g0695100 |
可能参与长日照(LD)条件下开花时间调控的转录因子。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000160 | phosphorelay signal transduction system | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.14; 覆盖度=51.005; E 值=1.44e-88; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.14; 覆盖度=51.005; E 值=1.44e-88; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.14; 覆盖度=51.005; E 值=1.44e-88; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0007623 | circadian rhythm | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.14; 覆盖度=51.005; E 值=1.44e-88; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009736 | cytokinin-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.14; 覆盖度=51.005; E 值=1.44e-88; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010017 | red or far-red light signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.14; 覆盖度=51.005; E 值=1.44e-88; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045892 | negative regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.14; 覆盖度=51.005; E 值=1.44e-88; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048511 | rhythmic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=61.667; 覆盖度=43.876; E 值=8.44e-84; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.14; 覆盖度=51.005; E 值=1.44e-88; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.14; 覆盖度=51.005; E 值=1.44e-88; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.14; 覆盖度=51.005; E 值=1.44e-88; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G02810 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.14; 覆盖度=51.005; E 值=1.44e-88 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0284100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=61.667; 覆盖度=43.876; E 值=8.44e-84 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |