基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_032652 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr07:27091595-27093454 (-) |
| 描述 | Similar to OTU9: OVARIAN TUMOR DOMAIN-containing deubiquitinating enzyme 9 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_032652 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g04250 |
水解酶,可在体外去除蛋白质上的结合泛素,因此可能在蛋白质周转水平上通过防止降解发挥重要的调控作用(可能)。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g03330 |
水解酶,可在体外去除蛋白质上的结合泛素,因此可能在蛋白质周转水平上通过防止降解发挥重要的调控作用(可能)。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g02070 |
水解酶,可在体外去除蛋白质上的结合泛素,因此可能在蛋白质周转水平上通过防止降解发挥重要的调控作用(可能)。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g22260 |
水解酶,可在体外去除蛋白质上的结合泛素,因此可能在蛋白质周转水平上通过防止降解发挥重要的调控作用(可能)。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006508 | proteolysis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.854; 覆盖度=44.35; E 值=3.58e-22; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.883; 覆盖度=101.13; E 值=7.15e-104; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=57.635; 覆盖度=57.345; E 值=5.4e-81; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=49.524; 覆盖度=59.322; E 值=1.75e-64; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004843 | cysteine-type deubiquitinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.883; 覆盖度=101.13; E 值=7.15e-104; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G02070 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=57.635; 覆盖度=57.345; E 值=5.4e-81 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G22260 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=49.524; 覆盖度=59.322; E 值=1.75e-64 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G03330 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=49.511; 覆盖度=86.723; E 值=6.66e-98 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G04250 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.883; 覆盖度=101.13; E 值=7.15e-104 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ddi:DDB_G0284757 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.854; 覆盖度=44.35; E 值=3.58e-22 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |