基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_032356 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr07:21256657-21260508 (-) |
| 描述 | Similar to PCMP-H77: Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g49142 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_032356 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000963 | mitochondrial RNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=39.111; 覆盖度=82.418; E 值=6.9e-173; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009451 | RNA modification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.19; 覆盖度=78.388; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016554 | cytidine to uridine editing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=39.111; 覆盖度=82.418; E 值=6.9e-173; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080156 | mitochondrial mRNA modification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.143; 覆盖度=82.662; E 值=7.3e-174; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.19; 覆盖度=78.388; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.143; 覆盖度=82.662; E 值=7.3e-174; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.19; 覆盖度=78.388; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.19; 覆盖度=78.388; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G12770 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.143; 覆盖度=82.662; E 值=7.3e-174 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G49142 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.19; 覆盖度=78.388; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G30700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=39.111; 覆盖度=82.418; E 值=6.9e-173 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |