基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_032251 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr07:19246985-19249177 (+) |
| 描述 | Similar to CAX2: Vacuolar cation/proton exchanger 2 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_032251 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g13320 |
液泡阳离子/质子交换器。 | |
At1g55730 |
液泡阳离子/质子交换器 (CAX)。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g55720 |
液泡阳离子/质子交换器 (CAX)。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0397400 |
液泡阳离子/质子交换器。 | |
Os04g0653200 |
液泡阳离子/质子交换器。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006816 | calcium ion transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=68.322; 覆盖度=91.164; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006874 | intracellular calcium ion homeostasis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.912; 覆盖度=97.414; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030001 | metal ion transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=68.322; 覆盖度=91.164; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0070588 | calcium ion transmembrane transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.912; 覆盖度=97.414; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005773 | vacuole | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=68.322; 覆盖度=91.164; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009705 | plant-type vacuole membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.912; 覆盖度=97.414; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0012505 | endomembrane system | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=68.322; 覆盖度=91.164; E 值=0.0; UniProt GO evidence=TAS:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015369 | calcium:proton antiporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.912; 覆盖度=97.414; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G55720 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=66.83; 覆盖度=87.716; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G55730 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=66.213; 覆盖度=95.043; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G13320 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=68.322; 覆盖度=91.164; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0397400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.912; 覆盖度=97.414; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0653200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=71.883; 覆盖度=88.147; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |