基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_031725 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr07:10265994-10266533 (-) |
| 描述 | Similar to GID2: F-box protein GID2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_031725 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g24210 |
SCF型E3连接酶复合物SCF(GID2)的必需组分,该复合物正向调节赤霉素信号通路。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g48170 |
SCF型E3连接酶复合物的重要组成部分,正向调节赤霉素信号通路。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0580300 |
某些 SCF 型 E3 连接酶复合物的重要组成部分,正向调节赤霉素信号通路。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009740 | gibberellic acid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.529; 覆盖度=94.972; E 值=1.76e-54; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009845 | seed germination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.529; 覆盖度=94.972; E 值=1.76e-54; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009937 | regulation of gibberellic acid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=41.958; 覆盖度=79.888; E 值=3.34e-23; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009939 | positive regulation of gibberellic acid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.529; 覆盖度=94.972; E 值=1.76e-54; UniProt GO evidence=IMP:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010162 | seed dormancy process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.529; 覆盖度=94.972; E 值=1.76e-54; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010265 | SCF complex assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=41.958; 覆盖度=79.888; E 值=3.34e-23; UniProt GO evidence=IDA:Gramene | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.529; 覆盖度=94.972; E 值=1.76e-54; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031146 | SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.529; 覆盖度=94.972; E 值=1.76e-54; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048831 | regulation of shoot system development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=30.714; 覆盖度=78.212; E 值=1.44e-11; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.529; 覆盖度=94.972; E 值=1.76e-54; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.529; 覆盖度=94.972; E 值=1.76e-54; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019005 | SCF ubiquitin ligase complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.529; 覆盖度=94.972; E 值=1.76e-54; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990756 | ubiquitin-like ligase-substrate adaptor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.529; 覆盖度=94.972; E 值=1.76e-54; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G24210 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.529; 覆盖度=94.972; E 值=1.76e-54 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G48170 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=30.714; 覆盖度=78.212; E 值=1.44e-11 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |