本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

下载当前结果

基因 IDLXL04_031310
当前查询版本OH1004
位置Chr07:4426202-4427791 (-)
描述Similar to PCMP-E78: Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g20540 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_031310 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g20540 含五螺旋肽重复的蛋白 At2g20540。 暂无已核实直接文献
At5g59200 参与叶绿体中的RNA编辑事件。
At5g56310 含五肽重复蛋白 At5g56310。 暂无已核实直接文献
At5g48910 含五次肽重复序列的蛋白At5g48910。 暂无已核实直接文献
At5g44230 含有五肽重复序列的蛋白 At5g44230。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006397mRNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.04; 覆盖度=93.951; E 值=3.21e-137; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009451RNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.113; 覆盖度=100.189; E 值=9.53e-136; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0031425chloroplast RNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.04; 覆盖度=93.951; E 值=3.21e-137; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0080156mitochondrial mRNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.577; 覆盖度=98.299; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:1900865chloroplast RNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.04; 覆盖度=93.951; E 值=3.21e-137; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005576extracellular region细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.645; 覆盖度=94.896; E 值=1.29e-127; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005739mitochondrion细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.577; 覆盖度=98.299; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.04; 覆盖度=93.951; E 值=3.21e-137; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003723RNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.577; 覆盖度=98.299; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003729mRNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.178; 覆盖度=97.543; E 值=2.98e-132; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008270zinc ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.178; 覆盖度=97.543; E 值=2.98e-132; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G20540KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.577; 覆盖度=98.299; E 值=0.0UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G44230KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.645; 覆盖度=94.896; E 值=1.29e-127UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G48910KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.178; 覆盖度=97.543; E 值=2.98e-132UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G56310KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.113; 覆盖度=100.189; E 值=9.53e-136UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G59200KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.04; 覆盖度=93.951; E 值=3.21e-137UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release