基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_030979 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:126178462-126180615 (+) |
| 描述 | Similar to CCDA2: Cytochrome c-type biogenesis ccda-like chloroplastic protein 2 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_030979 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g54290 |
还原当量从基质转移到类囊体腔所需的。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os12g0137300 |
可能参与将还原当量从基质转移到类囊体腔,并且对质体细胞色素b6f复合体的生物发生是必需的。 | 暂无已核实直接文献 |
Os11g0140800 |
可能参与将还原当量从基质转移到类囊体腔,并且对质体细胞色素b6f复合体的生物发生是必需的。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010190 | cytochrome b6f complex assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.741; 覆盖度=96.474; E 值=1.99e-160; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0017004 | cytochrome complex assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=30.085; 覆盖度=75.641; E 值=6.94e-34; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045454 | cell redox homeostasis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.741; 覆盖度=96.474; E 值=1.99e-160; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009534 | chloroplast thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=75.081; 覆盖度=99.038; E 值=1.46e-145; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.741; 覆盖度=96.474; E 值=1.99e-160; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031969 | chloroplast membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=30.085; 覆盖度=75.641; E 值=6.94e-34; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0055035 | plastid thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.741; 覆盖度=96.474; E 值=1.99e-160; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G54290 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=75.081; 覆盖度=99.038; E 值=1.46e-145 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os11g0140800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=77.741; 覆盖度=96.474; E 值=1.12e-159 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os12g0137300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.741; 覆盖度=96.474; E 值=1.99e-160 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |