基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_030948 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:125546278-125550828 (-) |
| 描述 | Similar to TOR1: Microtubule-associated protein TORTIFOLIA1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_030948 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g27060 |
植物特异性微管相关蛋白 ,调节皮质微管的方向和器官生长的方向。 | |
At1g50890 |
植物特异性微管相关蛋白 ,调节皮质微管的方向和器官生长的方向。 | |
At1g50900 |
参与光捕获复合蛋白 的导入以及随后将这些蛋白路由至叶绿体信号识别颗粒 途径。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os07g0520800 |
参与光捕获复合蛋白(LHCP)的导入及随后将这些蛋白转运到叶绿体信号识别颗粒(SRP)途径。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2YLX7 |
参与光捕获复合蛋白(LHCP)的导入及随后将这些蛋白转运到叶绿体信号识别颗粒(SRP)途径。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006886 | intracellular protein transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=78.626; 覆盖度=15.075; E 值=8.94e-63; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009826 | unidimensional cell growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.721; 覆盖度=70.196; E 值=2.19e-149; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010031 | circumnutation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.721; 覆盖度=70.196; E 值=2.19e-149; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0090391 | granum assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=78.626; 覆盖度=15.075; E 值=8.94e-63; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0170002 | halotropism | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=45.848; 覆盖度=63.751; E 值=2.43e-134; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.721; 覆盖度=70.196; E 值=2.19e-149; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=78.626; 覆盖度=15.075; E 值=8.94e-63; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=78.626; 覆盖度=15.075; E 值=8.94e-63; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=78.626; 覆盖度=15.075; E 值=8.94e-63; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010005 | cortical microtubule, transverse to long axis | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.721; 覆盖度=70.196; E 值=2.19e-149; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0055028 | cortical microtubule | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=45.848; 覆盖度=63.751; E 值=2.43e-134; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008017 | microtubule binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.721; 覆盖度=70.196; E 值=2.19e-149; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G50890 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=45.848; 覆盖度=63.751; E 值=2.43e-134 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G50900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=78.626; 覆盖度=15.075; E 值=8.94e-63 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G27060 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.721; 覆盖度=70.196; E 值=2.19e-149 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |