基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_030719 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:121354474-121357666 (-) |
| 描述 | Similar to ATM: Serine/threonine-protein kinase ATM (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_030719 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 27 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g48190 |
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，在如电离辐射 (IR) 或 DNA 复制暂停等基因毒性压力下激活检查点信号。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g09670 |
与 PDP1、PDP3 和 PDP6 一起，通过调节 PRC2 复合物的功能和调控 H3K27me3 水平，与 MSI4/FVE 和 MSI5 相互作用，以抑制 FLC、MAF4 和 MAF5 的表达，从而促进开花。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g40340 |
与 PDP1、PDP2 和 PDP6 一起，与 MSI4/FVE 和 MSI5 相互作用，通过调节 PRC2 复合体功能和调控 H3K27me3 水平抑制 FLC、MAF4 和 MAF5 的表达，从而促进开花。 | |
At5g02950 |
可能通过调节 PRC2 复合物的功能和调控 H3K27me3 水平来影响基因表达。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g27860 |
可能通过调节 PRC2 复合物的功能和调控 H3K27me3 水平来影响基因表达。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006281 | DNA repair | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.265; 覆盖度=20.829; E 值=2.5e-19; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006303 | double-strand break repair via nonhomologous end joining | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.265; 覆盖度=20.829; E 值=2.5e-19; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=29.798; 覆盖度=21.041; E 值=8.07e-18; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=29.798; 覆盖度=21.041; E 值=8.07e-18; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006974 | DNA damage response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.265; 覆盖度=20.829; E 值=2.5e-19; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0007129 | homologous chromosome pairing at meiosis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.265; 覆盖度=20.829; E 值=2.5e-19; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008380 | RNA splicing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.265; 覆盖度=20.829; E 值=2.5e-19; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009908 | flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=29.798; 覆盖度=21.041; E 值=8.07e-18; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010212 | response to ionizing radiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.265; 覆盖度=20.829; E 值=2.5e-19; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010332 | response to gamma radiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.265; 覆盖度=20.829; E 值=2.5e-19; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032204 | regulation of telomere maintenance | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.265; 覆盖度=20.829; E 值=2.5e-19; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0033044 | regulation of chromosome organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.265; 覆盖度=20.829; E 值=2.5e-19; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0040029 | epigenetic regulation of gene expression | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=29.798; 覆盖度=21.041; E 值=8.07e-18; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043247 | telomere maintenance in response to DNA damage | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.265; 覆盖度=20.829; E 值=2.5e-19; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045003 | double-strand break repair via synthesis-dependent strand annealing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.265; 覆盖度=20.829; E 值=2.5e-19; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051321 | meiotic cell cycle | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.265; 覆盖度=20.829; E 值=2.5e-19; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000028 | regulation of photoperiodism, flowering | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=29.798; 覆盖度=21.041; E 值=8.07e-18; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000785 | chromatin | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.265; 覆盖度=20.829; E 值=2.5e-19; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.265; 覆盖度=20.829; E 值=2.5e-19; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=30.0; 覆盖度=19.129; E 值=1.32e-15; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.265; 覆盖度=20.829; E 值=2.5e-19; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035098 | ESC/E(Z) complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=29.798; 覆盖度=21.041; E 值=8.07e-18; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000285 | 1-phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.265; 覆盖度=20.829; E 值=2.5e-19; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.265; 覆盖度=20.829; E 值=2.5e-19; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004674 | protein serine/threonine kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.265; 覆盖度=20.829; E 值=2.5e-19; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.265; 覆盖度=20.829; E 值=2.5e-19; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0106310 | protein serine kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.265; 覆盖度=20.829; E 值=2.5e-19; UniProt GO evidence=IEA:RHEA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G09670 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=29.798; 覆盖度=21.041; E 值=8.07e-18 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G40340 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=30.0; 覆盖度=19.129; E 值=1.32e-15 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |