基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_030613 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:119569723-119571252 (+) |
| 描述 | Similar to RPE: Ribulose-phosphate 3-epimerase%2C chloroplastic (Spinacia oleracea OX%3D3562) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_030613 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 18 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g61410 |
胚胎发生期间必需的蛋白质。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0169100 |
催化 D-核酮糖 5-磷酸与 D-木酮糖 5-磷酸之间的可逆表异构化反应。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0005975 | carbohydrate metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=83.274; 覆盖度=102.93; E 值=2.1e-169; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006098 | pentose-phosphate shunt | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=83.274; 覆盖度=102.93; E 值=2.1e-169; UniProt GO evidence=NAS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009052 | pentose-phosphate shunt, non-oxidative branch | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=83.274; 覆盖度=102.93; E 值=2.1e-169; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009409 | response to cold | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=88.306; 覆盖度=90.842; E 值=8.96e-163; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009624 | response to nematode | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=88.306; 覆盖度=90.842; E 值=8.96e-163; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019253 | reductive pentose-phosphate cycle | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=83.274; 覆盖度=102.93; E 值=2.1e-169; UniProt GO evidence=NAS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019323 | pentose catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=68.182; 覆盖度=80.586; E 值=4.46e-111; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=83.274; 覆盖度=102.93; E 值=2.1e-169; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=88.306; 覆盖度=90.842; E 值=8.96e-163; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=83.274; 覆盖度=102.93; E 值=2.1e-169; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=88.306; 覆盖度=90.842; E 值=8.96e-163; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=88.306; 覆盖度=90.842; E 值=8.96e-163; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009579 | thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=88.306; 覆盖度=90.842; E 值=8.96e-163; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=88.306; 覆盖度=90.842; E 值=8.96e-163; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010319 | stromule | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=88.306; 覆盖度=90.842; E 值=8.96e-163; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048046 | apoplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=88.306; 覆盖度=90.842; E 值=8.96e-163; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004750 | D-ribulose-phosphate 3-epimerase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=83.274; 覆盖度=102.93; E 值=2.1e-169; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=83.274; 覆盖度=102.93; E 值=2.1e-169; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G61410 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=88.306; 覆盖度=90.842; E 值=8.96e-163 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0169100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=88.142; 覆盖度=92.674; E 值=3.45e-162 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | syn:sll0807 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=68.182; 覆盖度=80.586; E 值=4.46e-111 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |