基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_030101 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:108191975-108199896 (-) |
| 描述 | Similar to TAF1: Transcription initiation factor TFIID subunit 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_030101 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g32750 |
TAF 是转录因子 IID (TFIID) 复合物的组成部分,对于介导 RNA 聚合酶转录的调节至关重要。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g19040 |
TAF 是转录因子 IID 复合物的组成部分,对于介导 RNA 聚合酶转录的调节至关重要。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os06g0645700 |
TFIID基础转录因子复合物的最大组成部分和核心支架。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009294 | DNA-mediated transformation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.077; 覆盖度=106.487; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009416 | response to light stimulus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.806; 覆盖度=103.189; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051123 | RNA polymerase II preinitiation complex assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.077; 覆盖度=106.487; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.077; 覆盖度=106.487; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005669 | transcription factor TFIID complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.077; 覆盖度=106.487; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004402 | histone acetyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.077; 覆盖度=106.487; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016251 | RNA polymerase II general transcription initiation factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.077; 覆盖度=106.487; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0017025 | TBP-class protein binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.077; 覆盖度=106.487; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G32750 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.077; 覆盖度=106.487; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G19040 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.806; 覆盖度=103.189; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ddi:DDB_G0292242 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=39.111; 覆盖度=24.739; E 值=1.01e-82 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:9266475 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=49.758; 覆盖度=102.199; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |