基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_029931 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:103544449-103545833 (+) |
| 描述 | Similar to Os08g0135800: Zinc finger CCCH domain-containing protein 55 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_029931 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g18640 |
含锌指 CCCH 结构域的蛋白 38。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g33835 |
转录激活因子，参与 FRIGIDA 介导的春化途径，但不参与自主开花途径。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os08g0135800 |
含锌指 CCCH 结构域的蛋白 55。 | 暂无已核实直接文献 |
Os05g0497500 |
含锌指CCCH结构域的蛋白质36。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009908 | flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=46.429; 覆盖度=20.948; E 值=1.93e-17; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010220 | positive regulation of vernalization response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=46.429; 覆盖度=20.948; E 值=1.93e-17; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030154 | cell differentiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=46.429; 覆盖度=20.948; E 值=1.93e-17; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.27; 覆盖度=36.908; E 值=5.61e-27; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.506; 覆盖度=38.404; E 值=1.12e-27; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.506; 覆盖度=38.404; E 值=1.12e-27; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G33835 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=46.429; 覆盖度=20.948; E 值=1.93e-17 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G18640 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.27; 覆盖度=36.908; E 值=5.61e-27 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0497500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=49.333; 覆盖度=18.703; E 值=5.87e-15 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os08g0135800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.506; 覆盖度=38.404; E 值=1.12e-27 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |