基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_029835 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:101529282-101532850 (+) |
| 描述 | Similar to GATA26: GATA transcription factor 26 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_029835 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g17570 |
转录调控蛋白,特异性结合基因启动子中的 5'-GATA-3' 或 5'-GAT-3' 基序。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g47140 |
转录调控蛋白,特异性结合基因启动子中的 5'-GATA-3' 或 5'-GAT-3' 基序。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g45170 |
转录激活因子,特异性结合基因启动子内的 5'-GATA-3' 或 5'-GAT-3' 基序。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g28340 |
转录激活因子,特异性结合基因启动子内的 5'-GATA-3' 或 5'-GAT-3' 基序。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g66320 |
转录激活因子,特异性结合基因启动子内的 5'-GATA-3' 或 5'-GAT-3' 基序。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.026; 覆盖度=99.449; E 值=1.58e-119; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=56.098; 覆盖度=7.537; E 值=6.72e-08; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006357 | regulation of transcription by RNA polymerase II | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=56.098; 覆盖度=7.537; E 值=6.72e-08; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030154 | cell differentiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=56.098; 覆盖度=7.537; E 值=6.72e-08; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045893 | positive regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=50.0; 覆盖度=8.088; E 值=5.27e-06; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.026; 覆盖度=99.449; E 值=1.58e-119; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.026; 覆盖度=99.449; E 值=1.58e-119; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.026; 覆盖度=99.449; E 值=1.58e-119; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.026; 覆盖度=99.449; E 值=1.58e-119; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G28340 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=48.78; 覆盖度=7.537; E 值=2.75e-06 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G45170 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=56.098; 覆盖度=7.537; E 值=6.72e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G17570 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.026; 覆盖度=99.449; E 值=1.58e-119 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G47140 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=44.693; 覆盖度=98.713; E 值=1.47e-109 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G66320 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=50.0; 覆盖度=8.088; E 值=5.27e-06 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |