基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_029771 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:99962230-99964359 (-) |
| 描述 | Similar to RAP: RAP domain-containing protein%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_029771 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g31890 |
RNA 结合蛋白,参与叶绿体 16S rRNA 成熟,这是支持叶绿体基因表达和生物发生的重要过程。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0425000 |
可能的RNA结合蛋白,在叶绿体发育中起重要作用。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000963 | mitochondrial RNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.538; 覆盖度=88.408; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.538; 覆盖度=88.408; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0044528 | regulation of mitochondrial mRNA stability | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.538; 覆盖度=88.408; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1901259 | chloroplast rRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.538; 覆盖度=88.408; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.538; 覆盖度=88.408; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005759 | mitochondrial matrix | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.538; 覆盖度=88.408; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.538; 覆盖度=88.408; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035770 | ribonucleoprotein granule | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.538; 覆盖度=88.408; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042644 | chloroplast nucleoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.538; 覆盖度=88.408; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042646 | plastid nucleoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.538; 覆盖度=88.408; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.538; 覆盖度=88.408; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G31890 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.538; 覆盖度=88.408; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0425000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=54.182; 覆盖度=85.008; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4333151 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=54.182; 覆盖度=85.008; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |