基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_029698 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:97406358-97408908 (+) |
| 描述 | Similar to BASS5: Probable sodium/metabolite cotransporter BASS5%2C chloroplastic (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_029698 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g22840 |
可能作为钠偶联代谢物运输体在叶绿体外膜上发挥功能。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g12030 |
质体转运蛋白,介导甲硫氨酸(Met)衍生的硫代葡萄糖苷中间体跨叶绿体膜转运,参与脂肪族硫代葡萄糖苷生物合成。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os09g0520600 |
可能作为钠偶联代谢物运输体在叶绿体外膜上发挥功能。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: B8BDK4 |
可能作为钠偶联代谢物运输体在叶绿体外膜上发挥功能。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0475400 |
可能作为钠偶联代谢物运输体在叶绿体外膜上发挥功能。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009611 | response to wounding | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=70.861; 覆盖度=68.95; E 值=2.9e-152; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009753 | response to jasmonic acid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=70.861; 覆盖度=68.95; E 值=2.9e-152; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019761 | glucosinolate biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=70.861; 覆盖度=68.95; E 值=2.9e-152; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0033506 | glucosinolate biosynthetic process from homomethionine | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=70.861; 覆盖度=68.95; E 值=2.9e-152; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=70.861; 覆盖度=68.95; E 值=2.9e-152; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.856; 覆盖度=80.594; E 值=6.02e-163; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=70.861; 覆盖度=68.95; E 值=2.9e-152; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.673; 覆盖度=76.027; E 值=6.1e-165; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.673; 覆盖度=76.027; E 值=6.1e-165; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008028 | monocarboxylic acid transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=70.861; 覆盖度=68.95; E 值=2.9e-152; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043879 | glycolate transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.856; 覆盖度=80.594; E 值=6.02e-163; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G12030 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=70.861; 覆盖度=68.95; E 值=2.9e-152 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G22840 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.856; 覆盖度=80.594; E 值=6.02e-163 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0475400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.172; 覆盖度=66.21; E 值=2.63e-64 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os09g0520600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.673; 覆盖度=76.027; E 值=6.1e-165 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |