基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_029678 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:96919026-96922711 (-) |
| 描述 | Similar to PLL1: Protein phosphatase 2C 29 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_029678 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g35350 |
参与花梗长度的调节以及控制芽和花分生组织干细胞身份的 CLAVATA 途径的调节。 | |
At2g46920 |
参与调节花梗长度及控制芽和花分生组织干细胞身份的CLAVATA途径。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g07630 |
参与叶片发育调控。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0690500 |
可能的蛋白磷酸酶 2C 26。 | 暂无已核实直接文献 |
Os03g0821300 |
作用于 XA21 病原体识别受体的蛋白磷酸酶。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.501; 覆盖度=107.867; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=58.94; 覆盖度=40.267; E 值=6.59e-115; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0007165 | signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.501; 覆盖度=107.867; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009826 | unidimensional cell growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.501; 覆盖度=107.867; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009933 | meristem structural organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.501; 覆盖度=107.867; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010074 | maintenance of meristem identity | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.501; 覆盖度=107.867; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048827 | phyllome development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=58.94; 覆盖度=40.267; E 值=6.59e-115; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.501; 覆盖度=107.867; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.501; 覆盖度=107.867; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.501; 覆盖度=107.867; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004722 | protein serine/threonine phosphatase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.501; 覆盖度=107.867; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005543 | phospholipid binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.501; 覆盖度=107.867; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.501; 覆盖度=107.867; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G35350 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.501; 覆盖度=107.867; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G46920 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=41.488; 覆盖度=118.267; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0690500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.022; 覆盖度=104.133; E 值=3.5e-170 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0821300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=58.94; 覆盖度=40.267; E 值=6.59e-115 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |