基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_029472 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:91600957-91603096 (-) |
| 描述 | Similar to DOF4.6: Dof zinc finger protein DOF4.6 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_029472 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g24060 |
能特异性结合5'-AA[AG]G-3'共识核心序列的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g61850 |
特异性参与种子萌发母本调控的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g64620 |
能特异性结合5'-AA[AG]G-3'共识核心序列的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0567800 |
可能在发育中的种子中转录激活种子储存蛋白基因的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0673700 |
可能在发育中的种子中转录激活种子储存蛋白基因的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.787; 覆盖度=55.592; E 值=6.01e-20; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.787; 覆盖度=55.592; E 值=6.01e-20; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009639 | response to red or far red light | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.333; 覆盖度=80.921; E 值=5.25e-17; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009845 | seed germination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.333; 覆盖度=80.921; E 值=5.25e-17; UniProt GO evidence=IMP:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045892 | negative regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.333; 覆盖度=80.921; E 值=5.25e-17; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.787; 覆盖度=55.592; E 值=6.01e-20; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.333; 覆盖度=80.921; E 值=5.25e-17; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.787; 覆盖度=55.592; E 值=6.01e-20; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003682 | chromatin binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.333; 覆盖度=80.921; E 值=5.25e-17; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.787; 覆盖度=55.592; E 值=6.01e-20; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.787; 覆盖度=55.592; E 值=6.01e-20; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G64620 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=40.952; 覆盖度=34.539; E 值=2.39e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G61850 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.333; 覆盖度=80.921; E 值=5.25e-17 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G24060 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.787; 覆盖度=55.592; E 值=6.01e-20 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0673700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=27.273; 覆盖度=119.408; E 值=5.53e-11 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0567800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.098; 覆盖度=107.895; E 值=7.06e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |