基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_029355 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:88285724-88287485 (+) |
| 描述 | Similar to LOL1: Protein LOL1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_029355 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g32540 |
活性氧诱导的细胞死亡的正调节剂。 | |
At4g20380 |
活性氧诱导的细胞死亡、冷应激诱导的细胞死亡、病原体诱导的过敏反应、基础抗病性的负调节剂。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os08g0159500 |
程序性细胞死亡和超敏反应(HR)的负调控因子。 | |
Os12g0611000 |
推测的锌指蛋白,可能参与程序性细胞死亡和防御反应。 | 暂无已核实直接文献 |
Os03g0639600 |
推测的锌指蛋白,可能参与程序性细胞死亡和防御反应。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009626 | plant-type hypersensitive response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.153; 覆盖度=89.116; E 值=1.07e-69; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030154 | cell differentiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=75.862; 覆盖度=98.639; E 值=9.99e-69; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031348 | negative regulation of defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=75.862; 覆盖度=98.639; E 值=9.99e-69; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034051 | negative regulation of plant-type hypersensitive response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=75.862; 覆盖度=98.639; E 值=9.99e-69; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034052 | positive regulation of plant-type hypersensitive response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.153; 覆盖度=89.116; E 值=1.07e-69; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043068 | positive regulation of programmed cell death | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.153; 覆盖度=89.116; E 值=1.07e-69; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045595 | regulation of cell differentiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=75.862; 覆盖度=98.639; E 值=9.99e-69; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0098542 | defense response to other organism | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.153; 覆盖度=89.116; E 值=1.07e-69; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000121 | regulation of removal of superoxide radicals | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.153; 覆盖度=89.116; E 值=1.07e-69; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.153; 覆盖度=89.116; E 值=1.07e-69; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.153; 覆盖度=89.116; E 值=1.07e-69; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.153; 覆盖度=89.116; E 值=1.07e-69; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G32540 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.153; 覆盖度=89.116; E 值=1.07e-69 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0639600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=57.895; 覆盖度=77.551; E 值=1.05e-41 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os08g0159500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=75.862; 覆盖度=98.639; E 值=9.99e-69 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os12g0611000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=61.062; 覆盖度=76.871; E 值=4.71e-44 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |