基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_029294 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:86392880-86394933 (+) |
| 描述 | Similar to Os02g0793000: Zinc finger CCCH domain-containing protein 18 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_029294 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g24830 |
含锌指CCCH结构域的蛋白22。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0793000 |
含锌指CCCH结构域的蛋白质18。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=25.658; 覆盖度=89.237; E 值=1.62e-28; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.0; 覆盖度=102.153; E 值=1.1e-158; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000978 | RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=25.658; 覆盖度=89.237; E 值=1.62e-28; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0001227 | DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=25.658; 覆盖度=89.237; E 值=1.62e-28; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.396; 覆盖度=103.718; E 值=7.29e-178; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.396; 覆盖度=103.718; E 值=7.29e-178; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G24830 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.0; 覆盖度=102.153; E 值=1.1e-158 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0793000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.396; 覆盖度=103.718; E 值=7.29e-178 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dse:6611892 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=25.658; 覆盖度=89.237; E 值=1.62e-28 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dya:Dyak_GE18884 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=25.219; 覆盖度=89.237; E 值=4.77e-26 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |