基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_028894 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:73684614-73689067 (+) |
| 描述 | Similar to BAM9: Inactive beta-amylase 9 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_028894 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 6 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g18670 |
非活性β-淀粉酶9。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g17090 |
β-淀粉酶活性。 | |
At3g23920 |
β-淀粉酶活性。 | |
At5g55700 |
无 α-1,4-葡聚糖水解酶活性,包括 β-淀粉酶、α-淀粉酶、α-葡萄糖苷酶或 α-淀粉葡萄糖苷酶。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0141200 |
体外具有β-淀粉酶活性。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000024 | maltose biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.281; 覆盖度=79.221; E 值=4.78e-109; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005983 | starch catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.93; 覆盖度=92.208; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009409 | response to cold | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.281; 覆盖度=79.221; E 值=4.78e-109; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009414 | response to water deprivation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.495; 覆盖度=86.271; E 值=6.59e-102; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.93; 覆盖度=92.208; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.93; 覆盖度=92.208; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.281; 覆盖度=79.221; E 值=4.78e-109; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.281; 覆盖度=79.221; E 值=4.78e-109; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.281; 覆盖度=79.221; E 值=4.78e-109; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016161 | beta-amylase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.93; 覆盖度=92.208; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G23920 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.495; 覆盖度=86.271; E 值=6.59e-102 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G17090 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.281; 覆盖度=79.221; E 值=4.78e-109 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G18670 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.93; 覆盖度=92.208; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G55700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=37.416; 覆盖度=83.302; E 值=1.38e-95 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0141200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=39.261; 覆盖度=80.334; E 值=2.65e-107 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4331577 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=39.261; 覆盖度=80.334; E 值=2.65e-107 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |