基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_028590 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:46891231-46895736 (-) |
| 描述 | Similar to OBE1: Protein OBERON 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_028590 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 21 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g07780 |
可能与OBE2共同维持和/或建立茎端及根分生组织的转录因子;可能通过控制WUS、PLT1、PLT2等分生组织相关基因和生长素应答所需基因的表达发挥作用。 | |
At1g14740 |
可能的转录因子,在垂体的规范和胚根的建立中与 OBE4 冗余地发挥作用。 | |
At5g48160 |
可能与OBE1共同维持和/或建立茎端及根分生组织的转录因子;可能通过控制WUS、PLT1、PLT2等分生组织相关基因和生长素应答所需基因的表达发挥作用。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0001708 | cell fate specification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=25.61; 覆盖度=52.063; E 值=7.54e-06; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.0; 覆盖度=45.714; E 值=5.73e-07; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.0; 覆盖度=45.714; E 值=5.73e-07; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009880 | embryonic pattern specification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=25.61; 覆盖度=52.063; E 值=7.54e-06; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010071 | root meristem specification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.0; 覆盖度=45.714; E 值=5.73e-07; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010078 | maintenance of root meristem identity | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.0; 覆盖度=45.714; E 值=5.73e-07; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010468 | regulation of gene expression | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.0; 覆盖度=45.714; E 值=5.73e-07; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010492 | maintenance of shoot apical meristem identity | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.0; 覆盖度=45.714; E 值=5.73e-07; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031347 | regulation of defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.0; 覆盖度=45.714; E 值=5.73e-07; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046740 | transport of virus in host, cell to cell | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.0; 覆盖度=45.714; E 值=5.73e-07; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080022 | primary root development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.0; 覆盖度=45.714; E 值=5.73e-07; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0090421 | embryonic meristem initiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=25.61; 覆盖度=52.063; E 值=7.54e-06; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000792 | heterochromatin | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.0; 覆盖度=45.714; E 值=5.73e-07; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.0; 覆盖度=45.714; E 值=5.73e-07; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005654 | nucleoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.0; 覆盖度=45.714; E 值=5.73e-07; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.0; 覆盖度=45.714; E 值=5.73e-07; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.0; 覆盖度=45.714; E 值=5.73e-07; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.0; 覆盖度=45.714; E 值=5.73e-07; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042802 | identical protein binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.0; 覆盖度=45.714; E 值=5.73e-07; UniProt GO evidence=IPI:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042803 | protein homodimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.0; 覆盖度=45.714; E 值=5.73e-07; UniProt GO evidence=TAS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046982 | protein heterodimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.0; 覆盖度=45.714; E 值=5.73e-07; UniProt GO evidence=TAS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G14740 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=25.61; 覆盖度=52.063; E 值=7.54e-06 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G07780 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.0; 覆盖度=45.714; E 值=5.73e-07 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G48160 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=24.828; 覆盖度=46.032; E 值=9.3e-06 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |