基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_027764 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:23609895-23610955 (+) |
| 描述 | Similar to TE1: Protein terminal ear1 (Zea mays OX%3D4577) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_027764 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
当前来源表未检出该物种的同源命中。
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0907900 |
可能的RNA结合蛋白。 | |
UniProt: A2WY46 |
可能的RNA结合蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
Os09g0531200 |
蛋白质 MEI2 样蛋白 6。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0517531 |
可能的RNA结合蛋白,可能在生长调节中发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000381 | regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.622; 覆盖度=55.019; E 值=1.18e-38; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045836 | positive regulation of meiotic nuclear division | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.491; 覆盖度=78.81; E 值=8.6e-29; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045927 | positive regulation of growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.491; 覆盖度=78.81; E 值=8.6e-29; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016607 | nuclear speck | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.622; 覆盖度=55.019; E 值=1.18e-38; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990904 | ribonucleoprotein complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=40.909; 覆盖度=57.249; E 值=6.87e-34; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.755; 覆盖度=53.16; E 值=1.15e-35; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.622; 覆盖度=55.019; E 值=1.18e-38; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | dosa:Os01g0907900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=44.755; 覆盖度=53.16; E 值=1.09e-35 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0517531 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.491; 覆盖度=78.81; E 值=8.6e-29 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os09g0531200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=40.909; 覆盖度=57.249; E 值=6.87e-34 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | zma:541683 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.622; 覆盖度=55.019; E 值=1.18e-38 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |