基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_027627 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:20646974-20649228 (-) |
| 描述 | Similar to MUR4: UDP-arabinose 4-epimerase 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_027627 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g30620 |
充当 UDP-D-木糖 4-差向异构酶,但在体外缺乏 UDP-D-葡萄糖和 UDP-D-葡萄糖醛酸 4-差向异构酶活性。 | |
At4g20460 |
可能的UDP-阿拉伯糖4-表异构酶3。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g34850 |
推定 UDP-阿拉伯糖 4-表异构酶 2。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0618200 |
可能的UDP-阿拉伯糖4-表异构酶2。 | 暂无已核实直接文献 |
Os07g0139400 |
可能是UDP-阿拉伯糖4-表异构酶1。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006012 | galactose metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.756; 覆盖度=99.515; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=77.805; 覆盖度=99.515; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009832 | plant-type cell wall biogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.756; 覆盖度=99.515; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019567 | arabinose biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.756; 覆盖度=99.515; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0033358 | UDP-L-arabinose biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.756; 覆盖度=99.515; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045227 | capsule polysaccharide biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.756; 覆盖度=99.515; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048868 | pollen tube development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=77.805; 覆盖度=99.515; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000138 | Golgi trans cisterna | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.756; 覆盖度=99.515; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005794 | Golgi apparatus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.756; 覆盖度=99.515; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032580 | Golgi cisterna membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.756; 覆盖度=99.515; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003978 | UDP-glucose 4-epimerase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.756; 覆盖度=99.515; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0050373 | UDP-arabinose 4-epimerase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.756; 覆盖度=99.515; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G30620 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.756; 覆盖度=99.515; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G34850 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=77.805; 覆盖度=99.515; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G20460 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=79.805; 覆盖度=99.757; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0139400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=76.399; 覆盖度=99.757; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |