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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_026762
当前查询版本OH1004
位置Chr06:2624192-2625951 (+)
描述Similar to ATL52: RING-H2 finger protein ATL52 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_026762 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g17600 RING-H2 指蛋白 ATL52。 暂无已核实直接文献
At4g10160 E3泛素蛋白连接酶,能够在体外通过与泛素结合酶 E2 UBC8、UBC10、UBC11 和 UBC34 的作用催化多泛素化。 暂无已核实直接文献
At4g10150 RING-H2 指蛋白 ATL7。 暂无已核实直接文献
At3g03550 RING-H2 指蛋白 ATL51。 暂无已核实直接文献
At4g17905 推定的RING-H2指蛋白ATL53。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006511ubiquitin-dependent protein catabolic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.023; 覆盖度=47.778; E 值=2.01e-19; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016567protein ubiquitination生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.577; 覆盖度=76.111; E 值=1.16e-19; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.023; 覆盖度=47.778; E 值=2.01e-19; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.577; 覆盖度=76.111; E 值=1.16e-19; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016020membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.577; 覆盖度=76.111; E 值=1.16e-19; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0004842ubiquitin-protein transferase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.023; 覆盖度=47.778; E 值=2.01e-19; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008270zinc ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.577; 覆盖度=76.111; E 值=1.16e-19; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0061630ubiquitin protein ligase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.577; 覆盖度=76.111; E 值=1.16e-19; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G03550KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=42.105; 覆盖度=42.222; E 值=1.55e-18UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G10150KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=35.714; 覆盖度=70.0; E 值=2.55e-19UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G10160KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.023; 覆盖度=47.778; E 值=2.01e-19UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G17905KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.909; 覆盖度=48.889; E 值=2.65e-18UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G17600KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.577; 覆盖度=76.111; E 值=1.16e-19UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release