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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_026755
当前查询版本OH1004
位置Chr06:2517104-2518756 (-)
描述Similar to PUB3: U-box domain-containing protein 3 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_026755 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g54790 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献
At2g23140 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献
At5g67340 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献
At5g42340 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献
At1g23030 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0007166cell surface receptor signaling pathway生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=27.972; 覆盖度=26.0; E 值=1.84e-08; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016567protein ubiquitination生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.0; 覆盖度=50.909; E 值=2.93e-16; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathwayUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0034614cellular response to reactive oxygen species生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.077; 覆盖度=59.091; E 值=2.4e-15; UniProt GO evidence=IGI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0048364root development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.077; 覆盖度=59.091; E 值=2.4e-15; UniProt GO evidence=IGI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0048658anther wall tapetum development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.077; 覆盖度=59.091; E 值=2.4e-15; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:1904821chloroplast disassembly生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.077; 覆盖度=59.091; E 值=2.4e-15; UniProt GO evidence=IGI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.0; 覆盖度=50.909; E 值=2.93e-16; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005737cytoplasm细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.0; 覆盖度=50.909; E 值=2.93e-16; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0061630ubiquitin protein ligase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.0; 覆盖度=50.909; E 值=2.93e-16; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G23140KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.077; 覆盖度=59.091; E 值=2.4e-15UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G54790KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.0; 覆盖度=50.909; E 值=2.93e-16UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G42340KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=27.972; 覆盖度=26.0; E 值=1.84e-08UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G67340KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=30.603; 覆盖度=42.182; E 值=3.99e-13UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release