基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_026497 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:127399839-127401076 (+) |
| 描述 | Similar to SGR1: Protein STAY-GREEN 1%2C chloroplastic (Solanum lycopersicum OX%3D4081) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_026497 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g22920 |
镁螯合酶,参与光系统I(PSI)和光系统II(PSII)叶绿素-蛋白复合体中叶绿素a的降解。 | |
At4g11910 |
镁螯合酶,参与光系统I(PSI)和光系统II(PSII)叶绿素-蛋白复合体中叶绿素a的降解。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010271 | regulation of chlorophyll catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=64.314; 覆盖度=91.727; E 值=2.62e-115; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015996 | chlorophyll catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.509; 覆盖度=99.64; E 值=1.5e-134; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1903647 | negative regulation of chlorophyll catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=59.636; 覆盖度=98.921; E 值=3.35e-113; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.509; 覆盖度=99.64; E 值=1.5e-134; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=64.207; 覆盖度=97.482; E 值=4e-120; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0055035 | plastid thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=59.636; 覆盖度=98.921; E 值=3.35e-113; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016829 | lyase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=64.207; 覆盖度=97.482; E 值=4e-120; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G11910 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=59.636; 覆盖度=98.921; E 值=3.35e-113 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G22920 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=64.207; 覆盖度=97.482; E 值=4e-120 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | cann:107866321 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=66.667; 覆盖度=99.281; E 值=2.07e-130 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sly:778212 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.509; 覆盖度=99.64; E 值=1.5e-134 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |