基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_026026 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:119902525-119904942 (-) |
| 描述 | Similar to At1g31840: Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g31840 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_026026 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 3 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g31840 |
推测的含五重复肽重复序列蛋白 At1g31840。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g39710 |
含五重复肽序列蛋白 At5g39710。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g62930 |
含有五百四十肽重复的蛋白 At1g62930,叶绿体。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g62670 |
含五肽重复序列的蛋白 At1g62670,线粒体。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: Q76C99 |
降低与细胞质雄性不育(CMS)相关的线粒体基因ORF79的表达,该基因编码一种细胞毒性肽。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=25.48; 覆盖度=97.019; E 值=1.93e-82; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.368; 覆盖度=101.988; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=25.48; 覆盖度=97.019; E 值=1.93e-82; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G31840 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.368; 覆盖度=101.988; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G39710 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=25.48; 覆盖度=97.019; E 值=1.93e-82 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |