基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_025599 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:114030212-114032238 (+) |
| 描述 | Similar to SCOA: Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit alpha-1%2C mitochondrial (Solanum lycopersicum OX%3D4081) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_025599 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g23250 |
琥珀酰辅酶A合成酶在三羧酸循环(TCA)中起作用,将琥珀酰辅酶A的水解与ATP的合成耦合,因此代表TCA中唯一的底物水平磷酸化步骤。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g08300 |
琥珀酰辅酶A合成酶在三羧酸循环(TCA)中起作用,将琥珀酰辅酶A的水解与ATP的合成耦合,因此代表TCA中唯一的底物水平磷酸化步骤。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os07g0577700 |
琥珀酰辅酶A合成酶在三羧酸循环(TCA)中起作用,将琥珀酰辅酶A的水解与ATP的合成耦合,因此代表TCA中唯一的底物水平磷酸化步骤。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006099 | tricarboxylic acid cycle | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.35; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006104 | succinyl-CoA metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.35; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006105 | succinate metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.35; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.35; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=83.478; 覆盖度=102.374; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=83.478; 覆盖度=102.374; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009361 | succinate-CoA ligase complex (ADP-forming) | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.35; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009505 | plant-type cell wall | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=83.478; 覆盖度=102.374; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000166 | nucleotide binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.35; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004775 | succinate-CoA ligase (ADP-forming) activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.35; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004776 | succinate-CoA ligase (GDP-forming) activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.35; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005507 | copper ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=84.412; 覆盖度=100.89; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=83.478; 覆盖度=102.374; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G08300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=83.478; 覆盖度=102.374; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G23250 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=84.412; 覆盖度=100.89; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sly:543943 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=86.31; 覆盖度=99.703; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |