基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_025479 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:112325785-112326803 (-) |
| 描述 | Similar to PSB27-1: Photosystem II repair protein PSB27-H1%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_025479 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010206 | photosystem II repair | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.896; 覆盖度=74.033; E 值=2.34e-61; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010207 | photosystem II assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.896; 覆盖度=74.033; E 值=2.34e-61; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071484 | cellular response to light intensity | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.896; 覆盖度=74.033; E 值=2.34e-61; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.896; 覆盖度=74.033; E 值=2.34e-61; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.896; 覆盖度=74.033; E 值=2.34e-61; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009523 | photosystem II | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.896; 覆盖度=74.033; E 值=2.34e-61; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009534 | chloroplast thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.896; 覆盖度=74.033; E 值=2.34e-61; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.896; 覆盖度=74.033; E 值=2.34e-61; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009543 | chloroplast thylakoid lumen | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.896; 覆盖度=74.033; E 值=2.34e-61; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009579 | thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.896; 覆盖度=74.033; E 值=2.34e-61; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031977 | thylakoid lumen | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.586; 覆盖度=73.481; E 值=2.27e-17; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G03600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.896; 覆盖度=74.033; E 值=2.34e-61 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | syn:slr1645 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=32.5; 覆盖度=66.298; E 值=1.89e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | tel:tll2464 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.586; 覆盖度=73.481; E 值=2.27e-17 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |