基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_025389 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:110951794-110952695 (-) |
| 描述 | Similar to At4g17486: DeSI-like protein At4g17486 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_025389 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g17486 |
类 DeSI 蛋白 At4g17486。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os11g0210300 |
醇脱氢酶1。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: Q75ZX4 |
醇脱氢酶1。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006508 | proteolysis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.177; 覆盖度=53.455; E 值=3.04e-39; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046294 | formaldehyde catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=87.234; 覆盖度=17.091; E 值=9.3e-20; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=87.234; 覆盖度=17.091; E 值=9.3e-20; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.177; 覆盖度=53.455; E 值=3.04e-39; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004022 | alcohol dehydrogenase (NAD+) activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=87.234; 覆盖度=17.091; E 值=9.3e-20; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=87.234; 覆盖度=17.091; E 值=9.3e-20; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051903 | S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase [NAD(P)+] activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=87.234; 覆盖度=17.091; E 值=9.3e-20; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0101005 | deubiquitinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.177; 覆盖度=53.455; E 值=3.04e-39; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G17486 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.177; 覆盖度=53.455; E 值=3.04e-39 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os11g0210300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=87.234; 覆盖度=17.091; E 值=2.39e-19 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | zma:542363 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=87.234; 覆盖度=17.091; E 值=1.64e-19 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |